SPR表面等离子共振技术|分子互作检测原理、参数与应用案例-强耀生物

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分子间相互作用强度和模式在药物研发中是衡量候选药物的重要指标。测量药物分子与靶标之间相互作用强度的方法有很多,包括NMR(核磁共振)、MST(微量热泳动)、ITC(等温滴定量热)、荧光偏振以及表面等离子共振技术。表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)技术是一种基于光学的生物分子相互作用体外仪器检测方法。通过检测生物传感芯片上配位体与分析物之间的相互作用情况,进而探测物质的性质和结构。本期内容主要带大家一起了解SPR。

Fig1. 表面等离子体共振(SPR)技术的应用

一、原理及流程

基于光在金属(通常是金)薄膜表面激发表面等离子体波的物理现象。当生物分子在金属传感器芯片表面结合时,会引起附近折射率的微小变化,从而导致共振角发生偏移。通过实时监测这个共振角的变化,就能实时、无标记地检测分子结合和解离的过程。

Fig2. SPR仪器的主要组成部分: (A) SPR 光学检测系统 (B) 信号采集系统 (C) 微流控系统

操作流程

1.配基偶联: 将两个物质中的一个作为配体偶联在芯片上;

2.样品进样: 另一个物质作为分析物从芯片上流过;如果两个物质有相互作用,仪器会进行记录;

3.芯片再生: 使用再生缓冲液去除全部的分析物;

4.数据分 析: 使用仪器自带的软件进行数据分析;

Fig3. SPR实验流程

二、SPR类型

SPR类型有两种,分别是SPR单浓度检测和SPR多浓度检测。

01 SPR单浓度检测

通常指在一次结合-解离循环中,依次注入单一浓度的多个不同分析物,即使用单一浓度的物质进行筛选,快速对大量候选互作的物质进行亲和力排序,多用于初步筛选研究中。SPR单浓度检测不能精确测定结合强度,无法得到准确的动力学参数。

Fig4. 51个小分子化合物对蛋白A的亲和力初筛(单浓度SPR)

02 SPR多浓度测定

指对同一种分析物,设置一系列梯度浓度,依次进样并完整记录每个浓度的结合和解离曲线。其可以做到精确分析,获取可靠的Ka、Kd和KD,全面揭示相互作用的动力学机制。

Fig5. 两种分子间的相互作用分析(多浓度SPR)

例如通过上述单浓度SPR技术(或者其他筛选实验)筛选出与蛋白A亲和性较好的化合物B,可通过多浓度SPR检测获得两者互作的动力学和亲和力参数,深入分析其互作机制。

三、动力学互作参数解读

1. 结合常数Ka

▸ 代表复合物(RL)的形成速率,在 1 M 的 R 和 L 下,每秒产生的复合物数量。

▸ 单位为 M⁻¹S⁻¹,一般从 10³ 到 10⁷ M⁻¹S⁻¹。

2. 解离常数Kd

▸ 反映了复合物的稳定性,每秒钟解离的复合物的百分比。

▸ Kd=0.01 S⁻¹,即为每秒钟有1%的复合物解离, Kd 越大,解离越快。

▸ 单位为S⁻¹,一般在 10⁻² 至 10⁻⁵ S⁻¹。

3. 亲和力常数KD

▸ 反映了相互作用结合能力的大小, 越小亲和力越高,Kd/Ka的比值,是平衡常数的倒数。

▸ 单位为 M,检测范围为 mM~pM。

📌 常见的生物分子间亲和力值范围

▫️ 亲和素-生物素结合:10⁻¹⁴ M

▫️ 强的抗原 - 抗体结合:10⁻⁸~10⁻¹⁰ M

▫️ DNA 与蛋白的结合:10⁻⁸~10⁻¹⁰ M

▫️ 较弱的抗原 - 抗体结合:10⁻⁶~10⁻⁷ M

▫️ 酶与底物结合:10⁻⁴~10⁻¹⁰ M

▫️ 蛋白与小分子结合:10⁻³~10⁻⁶ M

四、SPR检测可提供信息

(1)是否结合;

(2)结合的特异性与选择性;

(3)两种分子的结合强度(亲和力);

(4)结合和解离的快慢和复合体的稳定性(动力学);

(5)分子结合的温度与热力学特征;

(6)目标分子活性含量的检测;

(7)能跟踪监控固定的配体的稳定性。

五、SPR优势

1.无标记检测: 无需对样品进行标记,避免了标签、生物素或者同位素的干扰;

2.实时检测: 可以实时观察到分子间结合和解离的过程;

3.高分辨率,高灵敏度: 能够检测出非常弱的相互作用;

4.信息量多: 不仅可以检测有没有相互作用,还可以检测相互作用的亲和力,动力学和浓度等信息

Table1. 几种传统检测分子互作技术与SPR对比

六、经典案例

📌 案例一 蛋白-小分子相互作用

中科院北京基因组研究所江华亮团队在Cancer Cell上发表的名为“ Small-Molecule Targeting of E3 Ligase Adaptor SPOP in Kidney Cancer ”的论文中,研究者针对透明细胞肾细胞癌中SPOP蛋白的异常(在细胞质中过表达而非细胞核)会促进肿瘤生长的问题,成功设计并优化出一种小分子抑制剂6b。且利用SPR等实验明确了该抑制剂的核心机制:通过抑制SPOP与底物蛋白的相互作用,来阻断致癌信号通路。

Fig6. POP抑制剂与SPOP结合

📌 案例二 蛋白-蛋白相互作用

美国德克萨斯州大学何平团队在Nature上发表的名为“ Phytocytokine signalling reopens stomata in plant immunity and water loss ”的论文中,研究者利用SPR技术验证了SCREWs与受体激酶NUT的结合能力,检测结果表明SCREWs与NUT的亲和力达到了uM级别,表明两者的结合强度较好,由此确定了NUT是SCREWs的受体。

Fig7. SPR检测不同类型的SCREWs与NUT胞外域的亲和力

📌 案例三 蛋白-核酸相互作用

在Plant Physiology上发表的名为“ RBP differentiation contributes to selective transmissibilityof OPT3 mRNAs ”的论文探讨了OPT3在木本(苹果)与草本(拟南芥)中传递性的差异,研究利用SPR分析各属间RBPs与OPT3的亲和力,结果发现苹果的RBPs与苹果MdOPT3的亲和力显著高于拟南芥,阐明了OPT3 mRNA长距离传递能力种间差异的分子机制。

Fig8. 候选RBP与MdOPT3、MxOPT3和AtOPT3 3′-UTR结合的SPR分析

七、小结

SPR技术凭借无标记、实时、高灵敏的特性,已成为分子互作研究不可或缺的工具。了解生物分子间的相互作用有助于深入理解复杂的生物学过程,并为疾病的预防和治疗提供新视角。SPR分子互作技术凭借其实时性、灵敏性、多样性和灵活性,在生物医学研究和药物研发等领域发挥着关键作用。通过SPR技术,我们可以更全面地探索生物分子之间的相互作用,支持药物研发和疾病诊断。随着SPR技术的持续进步,我们对分子相互作用的认识将愈加深入,为生命科学研究开辟更多可能。

强耀生物提供专业 SPR 无标记分子互作检测技术服务,欢迎咨询订购~

参考文献1:DOI: 10.2147/IJN.S468695

参考文献2:10.1016/j.ymeth.2019.05.005

参考文献3:10.1007/978-1-62703-398-5_6

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