多肽计算器
多肽
氨基端 序列(请用1字符或3字符,可混合输入) 若是1字符,请输入大写字母 羧基端
强耀生物多肽计算器使用及结果分析指南
多肽序列输入
1 序列输入
您可以在“序列”下的方框内输入您的多肽序列(氨基端→羧基端),输入的格式可以为氨基酸的1字符或3字符,也可两者混合输入。
2 多肽N/C端修饰的选择
氨基端可供选择的修饰有乙酰化、生物素标记、焦谷氨酸化;羧基端可选择酰胺化。
结果分析
1 分子量
输入目标序列,可很迅速的计算出该多肽的分子量。
2 等电点
等电点即为目标多肽所带净电荷为零时的PH,其计算方法以具权威的“Lehninger Principles of Biochemistry”为依据。
3 PH为7时的净电荷
PH为7时的净电荷是指在PH=7的溶液中目标多肽所带的净电荷;当然,您还可以根据“Net charge”图表了解到在不同PH条件下目标多肽的净电荷情况。
4 平均亲水性
平均亲水性是根据多肽序列中各氨基酸残基以及不同修饰的亲/疏水值来得到的。从一条肽的平均亲水性值,我们可以判断其在水的溶解性如何。
平均亲水性值为2~3: 说明该多肽的溶解性非常的好;即使多肽短暂的与空气接触,也有吸潮的可能。为解决这个问题,强耀生物建立了能将空气湿度大大降低的GMP级实验室,多肽的分装工作都在此实验室中完成;同时,在发货的时候我们也会在多肽包装盒内放置高效的吸潮剂,大限度的降低了多肽吸潮的可能性。
平均亲水性值为0~2: 一般来讲,这样的多肽在水中溶解性都很好;无需添加助溶剂亦可取得较好的溶解效果。
平均亲水性值为=0: 多肽在水中的溶解性一般;可以通过以下方法来增加多肽的溶解性:1调整溶液的PH助溶; 2 超声助溶; 3 调整溶液温度(≤30℃)助溶; 4 添加助溶剂(如DMSO,DMF等),建议先将肽溶于有机溶剂,再缓慢加入水或其它缓冲溶液。 5 对于碱性肽,建议用10%乙酸溶解,对于酸性肽,建议用10%NH4HCO3溶解。
平均亲水性值为0~-2: 多肽在水中的溶解性较差;您可以利用以上5种方法助溶,同时也可在多肽序列中增加亲水性氨基酸,以增加多肽的亲水性。
平均亲水性值为-2~-3: 多肽在水中的溶解性非常的差;导致多肽很难纯化,多肽纯度亦很难提高,客户在运用这种多肽的时候,也会遇到多肽异常难溶的问题。遇到这种情况,我们一般会建议客户更换序列或在现有序列中加入亲水性氨基酸。
另外,多肽的溶解度还与其二级结构、修饰标记物的性质以及溶剂类型和终浓度有关系。
5亲水残基比例
指多肽序列中亲水性氨基酸残基数占总残基数的百分比。

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